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バイオグリッド スパコン創薬プロジェクト

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KBDD (K supercomputer-Based Drug Discovery project by Biogrid pharma consortium)プロジェクトとは、NPO法人バイオグリッドセンター関西が運営しているスパコンにおける創薬基盤を構築するコンソーシアムで、製薬企業約20社、IT企業2社、京大、阪大、産総研、横浜市大、兵庫県大、千葉大・医、都市活力研究所、神戸医療産業都市推進機構が参画しています。
2012年度には、蛋白質約600と低分子化合物3000万の相互作用を機械学習法(SVM)で計算し参画の製薬企業にデータを提供しました。
また、2012年度から蛋白質と化合物の結合自由エネルギーを見積もるアプリケーションMP-CAFEEの産業利用の可能性について検証を行なっており、計算精度の検証、一連のワークフローの構築、GUIの開発などを行なってきました。今後はこれらのノウハウを提供し、創薬の現場で利用できるようにし、さらに新たなアプリケーションについても順次検証を行い、創薬現場で利用できるようにする予定です。現在はMSM法を利用したKon、Koffの算出に取り組んでいます。

サイエンスZERONHK サイエンスZERO 「これが世界一のシミュレーション!“スーパーコンピュータ京”」
がNHK オンデマンドで1年間ネット配信。

KBDDメンバー

申請主体

NPO法人バイオグリッドセンター関西

製薬企業(50音順)

アクセリードドラッグディスカバリーパートナーズ(株)

旭化成ファーマ(株)

エーザイ(株)

科研製薬(株)

(株)カネカ

キッセイ薬品工業(株)

杏林製薬(株)

参天製薬(株)

塩野義製薬(株)

千寿製薬(株)

大正製薬(株)

田辺三菱製薬(株)

帝人ファーマ(株)

東レ(株)

日産化学(株)

日本新薬(株)

富士フイルム(株)

マルホ(株)

meiji seikaファルマ(株)

IT企業

(株)京都コンステラ・テクノロジーズ

三井情報(株)

大学(以下順不同)

京都大学大学院 医学研究科

大阪大学

兵庫県立大学

横浜市立大学

千葉大学 医学部

公的機関

(公財)都市活力研究所

産業技術総合研究所

(公財)神戸医療産業都市推進機構

理化学研究所



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